Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ApofQ91V80 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ApofQ91V80 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms