Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cul7Q8VE73 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cul7Q8VE73 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms