Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q8VDP2 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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