Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Fyco1Q8VDC1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fyco1Q8VDC1 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms