Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDB9

Slc6a20a, Sodium- and chloride-dependent transporter XTRP3A, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a20aQ8VDB9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Slc6a20aQ8VDB9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms