Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc58Q8R3Q6 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc58Q8R3Q6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ccdc58Q8R3Q6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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