Protein–RNA interactions for Protein: Q8R285

Vmn1r79, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r79Q8R285 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Vmn1r79Q8R285 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vmn1r79Q8R285 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms