Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxc12Q8K5B8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Hoxc12Q8K5B8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms