Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Q8

Colec12, Collectin-12, mousemouse

Predictions only

Length 742 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec12Q8K4Q8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Colec12Q8K4Q8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Colec12Q8K4Q8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms