Protein–RNA interactions for Protein: Q8K409

Polb, DNA polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolbQ8K409 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PolbQ8K409 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PolbQ8K409 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms