Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3W3

Casc3, Protein CASC3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casc3Q8K3W3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Casc3Q8K3W3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms