Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3G5

Vrk3, Inactive serine/threonine-protein kinase VRK3, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vrk3Q8K3G5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Vrk3Q8K3G5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Vrk3Q8K3G5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
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