Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2W6

Phf13, PHD finger protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf13Q8K2W6 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Phf13Q8K2W6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Phf13Q8K2W6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms