Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SrrdQ8K2M3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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SrrdQ8K2M3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SrrdQ8K2M3 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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SrrdQ8K2M3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SrrdQ8K2M3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SrrdQ8K2M3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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