Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Abcf3Q8K268 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms