Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Polr1eQ8K202 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms