Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh3Q8K1E6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms