Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cpne5Q8JZW4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cpne5Q8JZW4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms