Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Card11Q8CIS0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
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Card11Q8CIS0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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Card11Q8CIS0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Card11Q8CIS0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms