Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Csnka2ipQ8CH19 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Csnka2ipQ8CH19 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms