Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Upp2Q8CGR7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms