Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Snx8Q8CFD4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Snx8Q8CFD4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
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