Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE24

Pramef8, 4732496O08Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef8Q8CE24 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Pramef8Q8CE24 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Pramef8Q8CE24 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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