Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc87Q8CDL9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc87Q8CDL9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms