Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fbxo43Q8CDI2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fbxo43Q8CDI2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fbxo43Q8CDI2 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fbxo43Q8CDI2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fbxo43Q8CDI2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Fbxo43Q8CDI2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fbxo43Q8CDI2 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms