Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrif1Q8CDD9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrif1Q8CDD9 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrif1Q8CDD9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrif1Q8CDD9 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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Lrif1Q8CDD9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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Lrif1Q8CDD9 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrif1Q8CDD9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
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