Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RybpQ8CCI5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RybpQ8CCI5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms