Protein–RNA interactions for Protein: Q8CB27

Yod1, Ubiquitin thioesterase OTU1, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yod1Q8CB27 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yod1Q8CB27 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yod1Q8CB27 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Yod1Q8CB27 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Yod1Q8CB27 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Yod1Q8CB27 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Yod1Q8CB27 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms