Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ppfibp1Q8C8U0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ppfibp1Q8C8U0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms