Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6M1

Usp20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, mousemouse

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Length 916 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp20Q8C6M1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Usp20Q8C6M1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Usp20Q8C6M1 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Usp20Q8C6M1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
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