Protein–RNA interactions for Protein: Q8C601

BC049762, BC049762 protein, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC049762Q8C601 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
BC049762Q8C601 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms