Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4D8

Gm11541, Predicted gene 11541, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11541Q8C4D8 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gm11541Q8C4D8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm11541Q8C4D8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms