Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3X2

Ccdc90b, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc90bQ8C3X2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc90bQ8C3X2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms