Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ska3Q8C263 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska3Q8C263 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska3Q8C263 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska3Q8C263 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska3Q8C263 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska3Q8C263 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ska3Q8C263 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms