Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Atg16l1Q8C0J2 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Atg16l1Q8C0J2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms