Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx16Q8C080 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx16Q8C080 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms