Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZW8

Nhlrc2, NHL repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 725 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nhlrc2Q8BZW8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nhlrc2Q8BZW8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms