Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ube3dQ8BX13 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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