Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Zfp398Q8BV16 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Zfp398Q8BV16 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms