Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA3

Hmbox1, Homeobox-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmbox1Q8BJA3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmbox1Q8BJA3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms