Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA5

Krr1, KRR1 small subunit processome component homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krr1Q8BGA5 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Krr1Q8BGA5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krr1Q8BGA5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms