Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Necab1Q8BG18 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Necab1Q8BG18 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms