Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Liat1Q810M6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Liat1Q810M6 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms