Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
NanogQ80Z64 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NanogQ80Z64 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms