Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrfn4Q80XU8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrfn4Q80XU8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrfn4Q80XU8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Lrfn4Q80XU8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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Lrfn4Q80XU8 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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Lrfn4Q80XU8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Lrfn4Q80XU8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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