Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ttc28Q80XJ3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ttc28Q80XJ3 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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