Protein–RNA interactions for Protein: Q80W22

Thnsl2, Threonine synthase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thnsl2Q80W22 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Thnsl2Q80W22 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Thnsl2Q80W22 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.5 ms