Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Clec18aQ7TSQ1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Clec18aQ7TSQ1 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms