Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ctdp1Q7TSG2 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ctdp1Q7TSG2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms