Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC3

Nek5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, mousemouse

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Length 627 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek5Q7TSC3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Nek5Q7TSC3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Nek5Q7TSC3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms